9 月 21 日,齊碳科技有限公司(以下簡稱“齊碳科技”)發(fā)布了四代納米孔單分子基因測序儀QNome-9604。這是中國首臺自主研發(fā)的四代納米孔單分子基因測序儀,填補了中國市場的空白。
QNome-9604 小型便攜,一同發(fā)布的還有測序芯片 QCell-3841 和測序試劑盒 Qeagen-8。三者配合,可以達到 150k 以上的超長讀長,8 小時穩(wěn)定產(chǎn)出 500M,適用于微生物檢測、擴增子測序等快速靈活的使用場景,可分離式芯片設(shè)計極大降低單次使用成本。
QNome-9604 的發(fā)布,對于齊碳而言是一座重要里程碑,對于中國基因檢測行業(yè)來說,也是補足上游產(chǎn)業(yè)鏈、躋身世界一流測序市場的一大進展和突破。齊碳科技成立僅 4 年,一直在中國納米孔基因測序儀及配套試劑的自主研發(fā)、制造領(lǐng)域位居前列,深受資本青睞。2020 年 5 月,齊碳科技完成了由高榕資本領(lǐng)投,銀杏谷資本、雅惠投資等跟投的超 1 億元人民幣的 A 輪融資。
關(guān)于此次齊碳科技發(fā)布產(chǎn)品,生輝聯(lián)系到了高榕資本的項目負責人,他表示:“在上游產(chǎn)業(yè)中,高榕希望能助力國產(chǎn)測序儀品牌走自主創(chuàng)新道路。齊碳科技無論是團隊實力還是產(chǎn)品性能都處于國內(nèi)單分子測序儀業(yè)內(nèi)領(lǐng)先地位。我們也希望這次產(chǎn)品的發(fā)布是一個契機,能吸引更多下游服務開發(fā)商一起努力建立國內(nèi)基因測序的生態(tài)圈,共同推進單分子測序在科研端、臨床端的應用?!?/p>
國產(chǎn)測序儀如何突圍
基因測序市場高速增長,行業(yè)上下游合作引人關(guān)注。從全球的范圍來看,測序市場規(guī)模增長最快的是亞洲市場,中國和印度的市場增長率均超過 20%。從中國精準醫(yī)療市場結(jié)構(gòu)上來看,基因測序在精準診斷產(chǎn)業(yè)中占據(jù)了最大份額,所占比例達 52%。根據(jù) CB Insights 的市場調(diào)研報告,從 2015 年到 2020 年,全球醫(yī)療診斷領(lǐng)域的融資金額從 365 億美元增加到 764 億美元。
圖 | 醫(yī)療診斷領(lǐng)域融資情況(來源:CB Insights)
基因測序產(chǎn)業(yè)鏈主要分為上游基因測序設(shè)備制造廠商,中游面向終端用戶的測序服務機構(gòu)及生物信息分析機構(gòu),下游基因測序服務的使用者,包括醫(yī)療機構(gòu)、科研機構(gòu)、制藥公司和個人用戶等。其中,產(chǎn)業(yè)鏈上游是技術(shù)壁壘最高的環(huán)節(jié)之一,也是玩家最少的部分。從全球來看,上游基因測序儀大多被歐美大廠所壟斷,巨頭主要包括 Illumina、Thermo Fisher 以及 Roche。
在國內(nèi),位于產(chǎn)業(yè)鏈上游的公司屈指可數(shù)。上游的高價壟斷嚴重限制了中下游的發(fā)展,對于市場議價極不利好。隨著基因測序行業(yè)的發(fā)展,中下游提供各種基因測序產(chǎn)品和服務的公司層出不窮,全球基因測序市場以前所未有的速度發(fā)展,引領(lǐng)技術(shù)革新是走出基因測序下游產(chǎn)業(yè)競爭紅海的關(guān)鍵。無論是從國家層面,還是市場需求角度,國產(chǎn)替代已成一大趨勢。
如何從巨頭環(huán)伺的市場中突圍?齊碳科技選擇了第四代測序技術(shù)。
第四代測序技術(shù)也稱為納米孔單分子測序,是基于電信號測序的技術(shù),原理是通過電場力驅(qū)動單鏈核酸分子穿過納米尺寸的蛋白孔道,由于不同的堿基通過納米孔道時產(chǎn)生了不同阻斷程度和阻斷時間的電流信號,由此可根據(jù)電流信號識別每條核酸分子上的堿基信息,從而實現(xiàn)對單鏈核酸分子的測序
巨頭的動向揭示行業(yè)的風向。羅氏收購第四代測序技術(shù)公司 Genia 以及 Illumina 早前投資 Oxford Nanopore,并且后者目前估值已達到十五億英鎊,順利闖進以二代測序為主流的 “全球十大測序公司” 的陣營,這也從側(cè)面說明了市場對第四代技術(shù)的信心。
圖 | 全球十大測序公司
由于四代研發(fā)的困難,真正進入市場的公司寥寥無幾。目前,全球市場上研發(fā)四代測序的主要是 Oxford Nanopore 公司,旗下產(chǎn)品包括 Flongle、MinION、GridIONMk1、PrometnION 以及在研產(chǎn)品 SmidgION 和 Plongle。根據(jù)齊碳科技發(fā)布的產(chǎn)品參數(shù),讀長方面,QNome-9604 四代測序儀可以達到 150k 以上,通量方面,8 小時穩(wěn)定產(chǎn)出 500M,可以與 Oxford Nanopore 公司的 Flongle 對標。價格方面,齊碳科技具備一定優(yōu)勢,并且計劃與科研院所和醫(yī)療機構(gòu)等展開合作。
在中國市場上,齊碳科技是四代測序技術(shù)的領(lǐng)頭人,短短四年,實現(xiàn)從原理樣機到工程樣機的研發(fā),是中國唯一一家實現(xiàn)樣機開發(fā)并成功得到有效數(shù)據(jù)的企業(yè)。如今,產(chǎn)品定型發(fā)布上市,這一過程充滿挑戰(zhàn)。
以四代測序儀尋求突破
第四代測序儀的研發(fā)過程涉及多個學科,包括生物蛋白、流體芯片、信號處理電路、測序軟件等方面。并且,不同學術(shù)背景的研發(fā)人員相互交流、配合,需要不斷地學習磨合,才能夠?qū)崿F(xiàn)跨學科交流無阻礙。
齊碳科技解決這一挑戰(zhàn)的方式是組建一支跨學科的團隊。根據(jù)公開信息,齊碳科技聯(lián)合創(chuàng)始人白凈衛(wèi)、謝丹、胡庚分別是基因測序、生物信息和電子電路方面的專家,其研發(fā)團隊目前 70 余人,包括多位來自清華、北大、中科院、牛津大學等國內(nèi)外著名院校的高級專業(yè)人才。
其次,在這些學科領(lǐng)域上的研發(fā)都是不小的挑戰(zhàn),納米孔蛋白是納米孔基因測序儀的核心硬件,用來提供納米尺寸的蛋白質(zhì)孔道,控速蛋白用來控制單鏈核酸通過納米孔蛋白的速度。以上兩種蛋白都是通過生物學方法培養(yǎng)并提取出來的,其結(jié)構(gòu)設(shè)計和制造工藝都有較高的技術(shù)門檻。
此外,流體芯片需要為納米孔基因測序提供帶電的流體環(huán)境,增加測序通路,容納更多納米孔蛋白和控速蛋白并行測序,增加設(shè)備的通量和測序速度,同時提高穩(wěn)定性和耐用性。信號處理電路收集納米孔基因測序產(chǎn)生的皮安(pA)級別的極微弱電流,再加以放大,方便普通設(shè)備識別,同時要盡可能地去除噪音,保留有效信息。最后還需要開發(fā)人工智能算法,分析電信號,快速準確地讀出目標基因序列。
齊碳科技具有自主知識產(chǎn)權(quán)的納米孔蛋白和控速蛋白提升了測序速度和穩(wěn)定性;優(yōu)化的核酸文庫制備方案保證了長讀長測序能力和測序效率;創(chuàng)新設(shè)計的納米孔通道陣列結(jié)構(gòu)配合定制的 ASIC 專用集成電路,功能越來越強,尺寸越來越?。换?a target="_blank">深度學習技術(shù)的新型堿基識別算法提高了測序準確率。隨著生化、硬件和算法等基礎(chǔ)學科的進步,還將進一步提升納米孔基因測序儀的準確率和穩(wěn)定性。
“盡管基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組研究迄今已有超過 20 年的發(fā)展歷史,但是人類對生命遺傳本質(zhì)的理解依然只是掀開冰山一角。整個行業(yè)既需要下游應用的多元化突破,也需要上游儀器制造的技術(shù)迭代,提供更全面且精準的信息內(nèi)容、更快速且低成本的數(shù)據(jù)輸出。從技術(shù)實現(xiàn)路徑而言,以 SBS 為代表的 NGS 測序和以納米孔為代表的單分子測序是已得到市場驗證的技術(shù)路線,并且可以互補實現(xiàn) DNA、RNA、蛋白的信息拼圖?!?高榕資本的項目負責人對生輝說道。
基于以上的技術(shù)儲備,相較于當下主流的二代測序儀,QNome-9604 四代測序儀具備了長讀長能力、實時分析、直接測序、便攜易用的特點和優(yōu)勢。
圖 | 不同測序技術(shù)比較
讀長更長,更適合檢測基因組結(jié)構(gòu)變異,進行宏基因組測序;可以實時輸出測序結(jié)果,因而可用于即時檢測和快速診斷;可直接檢測過孔核酸,所以能檢測 DNA 甲基化、RNA 及其修飾;文庫制備簡單,便于提供一站式解決方案;同時,它的儀器本身小巧便攜,能把基因測序從專業(yè)實驗室里解放出來,走進基層、社區(qū),隨時隨地現(xiàn)場檢測,極具消費級應用的潛力。
第四代測序儀的研發(fā)極為困難,作為一家初創(chuàng)公司,齊碳科技用四年的時間帶來 QNome-9604 四代納米孔測序儀,打破了中國四代測序市場的空白,這是齊碳科技精準布局,專注市場需求的回報,也有望緩解歐美巨頭壟斷測序市場的局面。
人類對基因世界的探索征途才剛剛開始,QNome-9604 即將見證一個全新的測序時代的到來,將用低成本、高質(zhì)量、高通量的測序平臺,幫助科學家們實現(xiàn)自人類基因組計劃以來的夢想和希望。
提及對齊碳科技未來發(fā)展的期待,高榕資本項目負責人指出:“未來一方面期待齊碳不斷迭代升級現(xiàn)有產(chǎn)品,滿足更多下游服務伙伴公司們的需求;另一方面也期望齊碳能更深入挖掘納米孔作為一個平臺型技術(shù)的潛力,從基因組出發(fā),進一步探索技術(shù)的可延展性?!?/p>
-End-
原文標題:齊碳科技發(fā)布國產(chǎn)首臺四代基因測序儀,為中國基因測序市場加碼
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