QUANTUMESPRESSO在Device Studio中的應用

Device Studio（簡稱：DS）作為鴻之微的材料設計與仿真軟件，能夠進行電子器件的結(jié)構(gòu)搭建與仿真；能夠進行晶體結(jié)構(gòu)和納米器件的建模；能夠生成科研計算軟件 Nanodcal、Nanoskim、MOMAP、RESCU、DS-PAW、BDF、STEMS、TOPS、PODS、VASP、LAMMPS、QUANTUM ESPRESSO、Gaussian的輸入文件并進行存儲和管理；可以根據(jù)用戶需求，將輸入文件傳遞給遠程或本地的計算機進行計算，并控制計算流程；可以將計算結(jié)果進行可視化顯示和分析。

上一期的教程給大家介紹了Device Studio應用實例之LAMMPS應用實例的內(nèi)容，本期將介紹Device Studio應用實例之QUANTUMESPRESSO應用實例的內(nèi)容。

8.3.QUANTUMESPRESSO實例

QUANTUM ESPRESSO 是一款功能很強大的第一性原理計算開源軟件，ESPRESSO是opEn-Source Package的首字母縮寫，基于密度泛函理論、平面波及贗勢，可用于納米尺度下電子結(jié)構(gòu)計算。QUANTUM ESPRESSO 的核心平面波DFT模塊為PWscf（平面波自洽場），PWscf（平面波自洽場）使用平面波基集和偽勢能在密度泛函理論和密度泛函微擾理論范圍內(nèi)進行電子結(jié)構(gòu)計算的程序。目前，PWscf（平面波自洽場）模塊已經(jīng)集成在Device Studio中。

目前用戶可通過Device Studio進行 QUANTUM ESPRESSO 以下性質(zhì)的計算：結(jié)構(gòu)馳豫、自洽、能帶、態(tài)密度、DFT+U、共線自旋、非共線自旋、自旋軌道耦合。

以Si晶體結(jié)構(gòu)的自洽、能帶及態(tài)密度計算為例來詳細描述 QUANTUMESPRESSO 在Device Studio中的應用。

8.3.1.QUANTUM ESPRESSO計算流程

QUANTUM ESPRESSO在Device Studio中的計算流程如圖8.3-1所示。

圖8.3-1: QUANTUM ESPRESSO計算流程

8.3.2.QUANTUM ESPRESSO創(chuàng)建項目

雙擊Device Studio圖標快捷方式，登錄并啟動Device Studio，在創(chuàng)建或打開項目界面中(圖5.1-1: 啟動軟件后選擇創(chuàng)建或打開項目的圖形界面)，根據(jù)界面提示選擇創(chuàng)建一個新的項目（Create a new Project）或打開一個已經(jīng)存在的項目（Open an existing Project）的按鈕，選中之后點擊界面中的OK按鈕即可。若選擇創(chuàng)建一個新的項目，用戶可根據(jù)需要給該項目命名，如本項目命名為QUANTUMESPRESSO，或采用軟件默認項目名。

8.3.3.QUANTUM ESPRESSO導入結(jié)構(gòu)

在Device Studio中導入Si晶體結(jié)構(gòu)后的圖形界面如圖8.3-2。在Device Studio中導入Si晶體結(jié)構(gòu)的具體操作這里不做詳細說明，用戶可參照導入結(jié)構(gòu)節(jié)內(nèi)容。

圖8.3-2: 導入Si晶體結(jié)構(gòu)后的Device Studio圖形界面

8.3.4.QUANTUM ESPRESSO參數(shù)設置

在如圖8.3-2所示界面中選中Simulator→QUANTUM ESPRESSO→QUANTUM ESPRESSO，彈出界面如圖8.3-3（a）所示，用戶可根據(jù)所計算的結(jié)構(gòu)及計算需要在該界面中點擊不同的按鈕合理設置參數(shù)，之后點擊Generate files即可生成對應計算的輸入文件。

如生成Si晶體結(jié)構(gòu)的自洽、能帶及態(tài)密度計算的輸入文件，根據(jù)計算需要設置參數(shù)，分別選中Basic settings、Bandstructure、DensityOfStates，設置參數(shù)分別如圖8.3-3（b）、8.3-3（c）、8.3-3（d）所示，設置好參數(shù)后點擊Generate files即可生成Si晶體結(jié)構(gòu)自洽、能帶及態(tài)密度計算的輸入文件scf.in、band.in、nscf.in、dos.in。

8.3.5.QUANTUM ESPRESSO輸入文件的生成

生成Si晶體結(jié)構(gòu)的自洽、能帶和態(tài)密度計算的輸入文件scf.in、band.in、nscf.in、dos.in的Device Studio界面如圖8.3-4所示。其中，scf.in為自洽計算輸入文件；band.in為能帶計算輸入文件；由于態(tài)密度計算之前需要先進行一個非自洽計算，因此nscf.in和dos.in是態(tài)密度計算所需的輸入文件，計算順序為先nscf.in后dos.in。

圖8.3-4: 生成Si晶體結(jié)構(gòu)自洽、能帶、態(tài)密度計算輸入文件的Device Studio圖形界面

在如圖8.3-4所示界面中，選中scf.in→ 右擊 →Open with即可查看到Si晶體結(jié)構(gòu)自洽計算輸入文件如下所示。對于其他輸入文件，用戶可根據(jù)計算需要選擇是否打開查看，這里不做詳細說明。

8.3.6.QUANTUM ESPRESSO計算

在如圖8.3-4所示界面中，在Device Studio的Project Explorer區(qū)域選中scf.in→ 右擊 →Run，彈出Run界面如圖8.3-5所示，點擊界面中的Run按鈕則可進行Si晶體結(jié)構(gòu)的自洽計算。以此類推，分別選中band.in、nscf.in、dos.in文件重復上述步驟進行Si的能帶和態(tài)密度計算。

在計算過程中，用戶可在Job Manager區(qū)域觀察自洽、能帶和態(tài)密度計算的計算狀態(tài)，當計算任務處于排隊中、計算中和計算完成時，Status分別為Queued、Running、Finished，計算完成后Device Studio圖形界面如圖8.3-6所示。其中，scf.out、bs.out和nscf.out分別為Si晶體結(jié)構(gòu)自洽、能帶和非自洽計算的日志文件；dos.out和Si.dos分別為Si態(tài)密度計算的日志文件和數(shù)據(jù)文件。

圖8.3-5: Run界面

圖8.3-6: Si晶體結(jié)構(gòu)自洽、能帶和態(tài)密度計算完成的Device Studio圖形界面

8.3.7.QUANTUM ESPRESSO計算結(jié)果的可視化分析

對于Si的能帶和態(tài)密度計算結(jié)果bs.out和Si.dos，Device Studio可將其進行顯示供用戶進行相關分析，即計算結(jié)果的可視化分析。如bs.out，在如圖8.3-6所示界面的Project Explorer區(qū)域選中bs.out→ 右擊 →Show View，則彈出Si的能帶可視化分析界面如圖8.3-7所示，用戶可通過滾動鼠標中鍵將可視化分析結(jié)果放大或縮小。選中如圖8.3-7所示界面中Export快捷圖標，彈出導出可視化分析結(jié)果的圖形界面，用戶可根據(jù)需要選擇圖片的保存路徑和保存格式，并給所保存的圖片命名。

在Device Studio的Project Explorer區(qū)域選中Si.dos→ 右擊 →Show View，則彈出Si的態(tài)密度可視化分析界面如圖8.3-8所示。

圖8.3-7: Si晶體能帶（bs.out）的可視化分析界面

圖8.3-8: Si晶體態(tài)密度（Si.dos）的可視化分析界面

審核編輯 ：李倩