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基于環(huán)介導(dǎo)等溫擴增的紙基核酸快速檢測

微流控 ? 來源:微流控 ? 作者:微流控 ? 2022-10-12 16:27 ? 次閱讀

核酸分子具有豐富的遺傳信息,對疾病診斷具有關(guān)鍵價值。傳統(tǒng)核酸檢測技術(shù)受限于耗時長、需大型儀器設(shè)備等局限,嚴重制約了其在大規(guī)模、突發(fā)性疾病檢測中的應(yīng)用。紙基微流控具有便攜、自驅(qū)動等優(yōu)勢,在整合等溫擴增技術(shù)后,為核酸分子快速、準確的檢測提供可能。

據(jù)麥姆斯咨詢報道,近期,來自重慶大學(xué)等科研機構(gòu)的研究人員,于《重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報》發(fā)表綜述文章,從紙基微流控的設(shè)計出發(fā),總結(jié)了紙基微流控在核酸分子檢測中的研究進展,并分析了影響其檢測靈敏度、穩(wěn)定性等的干擾因素,為推動紙基微流控向臨床轉(zhuǎn)化提供重要參考。

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圖1 基于紙基微流控的核酸檢測技術(shù)

基于環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(LAMP)的紙基核酸快速檢測

LAMP體系中Mg2?、焦磷酸等副產(chǎn)物的變化常被作為核酸檢測依據(jù)。為與紙基微流控更好地整合,基于體系中Mg2?的濃度變化,有研究人員利用多層紙基材料進行3D組裝,結(jié)合蠟染技術(shù)構(gòu)建了多個具有縱向流體空間的LAMP反應(yīng)區(qū)(圖2A),僅需一步加樣,即可通過Mg2?敏感染料羥基萘酚藍的熒光特性對LAMP信號進行實時分析。此外,利用LAMP擴增過程中能產(chǎn)生大量焦磷酸,導(dǎo)致反應(yīng)體系的pH發(fā)生明顯改變這一特點的紙基pH指示法,已在寨卡病毒等檢測中被證明具有較高靈敏度,檢測限低至1拷貝/μL。除了利用LAMP反應(yīng)體系本身的特性變化作為檢測依據(jù)外,其他報道的紙基LAMP信號輸出方法還包括底物顯色、熒光標記和基于流體層析距離(圖2B)的檢測等。然而,上述研究大多依靠單獨的擴增步驟。為將擴增與檢測整合于一體,有研究人員設(shè)計了一種瘧疾檢測POCT裝置(圖2C),并通過整合一個多功能3D紙帶進行臨床血液樣本的擴增前預(yù)處理;經(jīng)LAMP反應(yīng)后,靶標能繼續(xù)與通道中預(yù)儲存的紅色微球結(jié)合,隨后在2D紙基微流控上完成檢測,實現(xiàn)了擴增與檢測一體化。

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圖2 基于LAMP技術(shù)的紙基核酸快速檢測

基于重組酶聚合酶擴增(RPA)的紙基核酸快速檢測

與LAMP相比,RPA技術(shù)能夠在37℃的室溫條件下在20mi內(nèi)實現(xiàn)靶核苷酸的高效常溫擴增。由于RPA具有相對較低的最適擴增溫度,因此在選擇疏水區(qū)構(gòu)建方法時無須考慮反應(yīng)溫度對疏水材料的影響,便于直接在紙基微流控上實現(xiàn)擴增與檢測一體化。

基于雜交鏈式反應(yīng)(HCR)的紙基核酸快速檢測

HCR是一種無酶核酸擴增技術(shù),該技術(shù)的提出使得核酸分子的體外擴增擺脫了對聚合酶的依賴,進一步降低了紙基核酸快速檢測裝置的生產(chǎn)、存儲成本。目前,已有相關(guān)研究利用HCR反應(yīng)設(shè)計了一種能更高效檢測沙門菌的紙基微流控芯片(圖3A)。此外,有研究人員在基于HCR反應(yīng)的同時巧妙地利用了紙張的咖啡環(huán)效應(yīng)作為信號轉(zhuǎn)導(dǎo)手段(圖3B),將體系中液體的蒸發(fā)過程轉(zhuǎn)化為紙張末端彩色條帶的形成過程,僅需測量著色帶長度即可對miRNA-21進行定量,檢測限為0.2pmol/L,為提高檢測靈敏度提供了新思路。

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圖3 基于HCR 技術(shù)的紙基核酸快速檢測

基于催化發(fā)卡自組裝反應(yīng)(CHA)的紙基核酸快速檢測

CHA是在HCR技術(shù)基礎(chǔ)上開發(fā)的一種更高效、更靈敏的無酶信號放大技術(shù)。CHA與HCR的主要區(qū)別在于,CHA反應(yīng)中靶標觸發(fā)級聯(lián)放大效應(yīng)后并不會作為生成物的一部分參與后續(xù)延伸,而是會被重新釋放到體系中充當“催化劑”繼續(xù)觸發(fā)下一段CHA反應(yīng),產(chǎn)生更明顯的信號放大效果。無酶催化的CHA具有更高靈敏度和放大效率,在紙基微流控中是一種同樣經(jīng)濟且更適用于微量靶標的檢測手段。

基于CHA反應(yīng)強大的信號放大效果,研究人員開發(fā)了一種能夠在紙質(zhì)芯片上具有雙重放大能力的早期胰腺癌診斷卡(圖4A)。與傳統(tǒng)的免疫分析試紙條相比,該設(shè)計通過同時引入CHA和金沉積手段達到更高的檢測靈敏度。為了縮短反應(yīng)時間、提高檢測效率,研究人員進一步將該技術(shù)進行了拓展:在靶標觸發(fā)CHA反應(yīng)后,分別利用量子點和多色熒光基團標記取代了金增強步驟(圖4B-C),實現(xiàn)對miRNA-21和丙型肝炎病毒精確定量的同時將反應(yīng)時間縮短至原來的1/3。

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圖4 基于CHA技術(shù)的紙基核酸快速檢測

總體而言,紙基微流控技術(shù)自21世紀初研發(fā)以來取得了巨大進步,已成為臨床POCT領(lǐng)域的重要組成部分。隨著研究的深入,其在核酸快速檢測領(lǐng)域的檢測靈敏度、功能集成度等方面取得了較大突破;加之便攜式信號分析設(shè)備開發(fā)以及機器學(xué)習(xí)算法的引入正在逐步提高紙基微流控在核酸檢測中的定量分析能力,并逐步向智能化、通用化邁進。近年來系列核酸等溫擴增技術(shù)被相繼開發(fā)后,核酸擴增擺脫了梯度溫控設(shè)備的限制,紙基微流控核酸檢測技術(shù)也因此迎來了高速發(fā)展。但用于核酸檢測的紙基微流控裝置在進行臨床或復(fù)雜環(huán)境下的評估之前,必須在實驗室進行大量的測試和改良工作,以應(yīng)對真實應(yīng)用場景下可能出現(xiàn)的各種問題。此外,將核酸檢測涉及的多個樣本預(yù)處理步驟集成在紙質(zhì)設(shè)備中,將難以避免地提升裝置的復(fù)雜程度,在此情況下如何同時方便用戶使用的問題也不容忽視。

審核編輯:郭婷

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原文標題:綜述:基于紙基微流控的核酸分子快速檢測技術(shù)研究進展

文章出處:【微信號:Micro-Fluidics,微信公眾號:微流控】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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