MIT研究員最新AI模型可提前5年預(yù)測乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)！

乳腺癌是美國第二大、中國第一大女性惡性腫瘤相關(guān)的致死因素。2019年的最新數(shù)據(jù)顯示，美國有近27萬名女性被診斷為乳腺癌，4萬多人因此死亡。在中國，僅2015年就有約28萬乳腺癌新發(fā)病例，位居女性惡性腫瘤發(fā)病的首位。在現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的眾多研究領(lǐng)域中，如何盡早發(fā)現(xiàn)和治療乳腺癌，早已成為一個(gè)十分重要的核心課題。

近日，來自麻省理工學(xué)院計(jì)算機(jī)科學(xué)與人工智能實(shí)驗(yàn)室（MIT CSAIL）和馬薩諸塞州綜合醫(yī)院的研究人員合作，共同打造出了一種深度學(xué)習(xí)模型。通過分析約9萬張乳腺X光照片與6萬多名患者的真實(shí)數(shù)據(jù)，該模型可以找出人眼不易察覺的精細(xì)信息和規(guī)律，作為預(yù)測女性是否可能在未來五年內(nèi)罹患乳腺癌的依據(jù)。相比于傳統(tǒng)檢測模型，該模型將預(yù)測準(zhǔn)確率從18%提高到31%，在不同族裔女性罹患乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測普適性上取得突破。

新的深度學(xué)習(xí)模型可以在癌癥發(fā)?。ㄓ覉D）前4年，識(shí)別出乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)（左圖）

個(gè)性化檢查方案，抓住最佳治療時(shí)機(jī)

乳腺X光檢查技術(shù)是目前臨床醫(yī)學(xué)廣泛使用的檢測乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的手段，但業(yè)界對檢查頻次和合適的檢查年齡一直存在爭議。美國癌癥協(xié)會(huì)認(rèn)為女性應(yīng)從45歲開始進(jìn)行年度檢查，有些機(jī)構(gòu)則建議50歲以上的女性每兩年接受一次檢查。不過由于個(gè)人體質(zhì)各異，其罹患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)也不同，以年齡作為標(biāo)準(zhǔn)劃分篩查頻率過于泛化，很容易無法及時(shí)發(fā)現(xiàn)早期乳腺癌而錯(cuò)失最佳治療時(shí)機(jī)。另外，由于X光的輻射性和乳腺的敏感性，很多人甚至認(rèn)為乳腺癌X光篩查對女性有一定危害。

針對這一情況，MIT的研究人員認(rèn)為如果能夠提前預(yù)測出女性罹患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)系數(shù)，可以幫助個(gè)體制定更完善的個(gè)性化篩查方案，如建議高危人群在 30 多歲時(shí)進(jìn)行年度檢查，低危人群則每三年檢查一次。該論文的作者之一Regina Barzilay博士是乳腺癌幸存者，她希望通過該模型幫助更多女性將乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)扼殺在搖籃中，抑制其發(fā)病率增長趨勢。

Regina Barzilay博士

設(shè)計(jì)檢測模型，獲取精準(zhǔn)信息

自1989年第一個(gè)乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測模型誕生以來，很多風(fēng)險(xiǎn)因素被囊括在內(nèi)：年齡、家族遺傳、荷爾蒙和生殖激素、乳腺密度等。但是由于大多數(shù)因素與乳腺癌的關(guān)聯(lián)度較低，導(dǎo)致這些傳統(tǒng)模型對個(gè)體的預(yù)測并不準(zhǔn)確。

與傳統(tǒng)的檢測模型不同，MIT的研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)出了一種全新的深度學(xué)習(xí)模型——基于邏輯回歸模型+圖片識(shí)別深度學(xué)習(xí)模型的混合模型，使用乳腺X光照片與真實(shí)已知結(jié)果對模型進(jìn)行訓(xùn)練、驗(yàn)證和測試。

“1960年以來，放射科醫(yī)生已經(jīng)注意到女性乳腺X光片上可以看到各具特性且不斷變化的乳房組織，代表著遺傳、激素、懷孕、哺乳、飲食、體重變化對乳腺產(chǎn)生的影響。現(xiàn)在我們可以利用深度學(xué)習(xí)在風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估中更準(zhǔn)確地利用這些詳細(xì)信息，從而提出個(gè)性化的預(yù)測結(jié)果和預(yù)防方案?！盧egina Barzilay表示。

首先，每一個(gè)風(fēng)險(xiǎn)因素都會(huì)經(jīng)過獨(dú)熱編碼（one-hot encoding）——一種在機(jī)器學(xué)習(xí)中常見的變量轉(zhuǎn)換機(jī)制，將變量的狀態(tài)用 0 和 1 組成的二進(jìn)制向量表示，再將所有編碼整合組成風(fēng)險(xiǎn)因素向量，作為邏輯回歸模型（risk-factor-based logistic regression model: RF-LR）的輸入值。

在此基礎(chǔ)上，研究人員又開發(fā)了一套以深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（CNN）為核心的圖片識(shí)別模型（image-only DL），使用開源的預(yù)訓(xùn)練模型 ResNet-18 。他們沒有根據(jù)圖片分辨率變化調(diào)整模型，直接以1664 x 2048 像素的乳腺X 光照片作為輸入值進(jìn)行訓(xùn)練。

風(fēng)險(xiǎn)因素的訓(xùn)練、驗(yàn)證及測試

最后，他們整合了邏輯回歸和圖像識(shí)別兩個(gè)模型，制作了一個(gè)混合模型（Hybrid DLModel）。結(jié)合風(fēng)險(xiǎn)因素和圖像信息，該模型開始學(xué)習(xí)預(yù)測女性在五年內(nèi)是否會(huì)出現(xiàn)乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)。

幾種模型預(yù)測準(zhǔn)確率的比較

以乳腺密度為例，與目前臨床上使用乳腺密度作為評(píng)估乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)準(zhǔn)的Tyrer-Cuzick模型相比，該模型識(shí)別風(fēng)險(xiǎn)的準(zhǔn)確率有所提高。研究人員發(fā)現(xiàn)，高乳腺密度且模型評(píng)估乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)高的患者癌癥發(fā)病率，是乳腺密度和乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)都較低的患者的3.9倍。這一趨勢在不同女性群體中都體現(xiàn)了出來。

對不同族裔的女性預(yù)測準(zhǔn)確率相同

值得注意的是，該論文提出的深度學(xué)習(xí)模型提高了對不同族裔女性的預(yù)測適用性，而包括Tyrer-Cuzick模型在內(nèi)的很多現(xiàn)有模型大多依照白人女性數(shù)據(jù)建立，對非白人族裔的預(yù)測效果較差。該論文的突破對于預(yù)防乳腺癌的種族平等尤為重要，數(shù)據(jù)顯示黑人女性罹患乳腺癌的機(jī)率比白人女性高40％，這可能由于不同族裔女性在檢測和獲得醫(yī)療保健方面的差異。

模型對不同族裔女性未來5年罹患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測

研究人員成該深度學(xué)習(xí)模型在未來可以為乳腺X光檢查奠定基礎(chǔ)，從而預(yù)測患者是否可能存在其他健康風(fēng)險(xiǎn)，如心血管疾病、胰腺癌等。他們希望這個(gè)模型能幫助更多人早發(fā)現(xiàn)、早預(yù)防、早治療，將癌癥風(fēng)險(xiǎn)扼殺于搖籃之中。