北鯤云超算平臺(tái)助力生命科學(xué)研究

提到北鯤云，許多業(yè)內(nèi)同僚首先想到的是，這是一家為有提供高性能算力SAAS服務(wù)及整合企業(yè)線下及云上資源，提供安全、彈性、自主的企業(yè)級(jí)Cloud-HPC方案的云計(jì)算公司。隨著云計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施和技術(shù)的成熟，諸如生命科學(xué)、人工智能、芯片設(shè)計(jì)、工業(yè)仿真、大氣海洋等行業(yè)對(duì)于云計(jì)算的需求快速增長(zhǎng)。北鯤云正是基于這樣的市場(chǎng)需求自主研發(fā)了北鯤云超算平臺(tái)，今天我們以生命科學(xué)行業(yè)為例，具體看看北鯤云超算平臺(tái)是如何加速生命科學(xué)研究的。

眾所周知，高性能計(jì)算在生命科學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用是近幾年才出現(xiàn)的，而且主要應(yīng)用在基因測(cè)序、分子動(dòng)力學(xué)模擬，以及虛擬篩選等流程。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)就是通過(guò)實(shí)驗(yàn)儀器對(duì)生物分子進(jìn)行測(cè)量，然后使用一些后處理軟件對(duì)原始的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和分析，接著對(duì)序列數(shù)據(jù)進(jìn)行同源及相似性搜尋、比對(duì)、序列分析、遺傳發(fā)育分析等。而分子動(dòng)力學(xué)模擬則是對(duì)于原子和電子所構(gòu)成的多體系統(tǒng)，用計(jì)算機(jī)模擬原子核的運(yùn)動(dòng)過(guò)程，從而計(jì)算這個(gè)多體系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)。虛擬篩選是根據(jù)模擬小分子配體與生物大分子受體的相互作用，預(yù)測(cè)兩者間的結(jié)合模式和親和力，從而進(jìn)行藥物的虛擬篩選。

藥物的虛擬篩選是依靠其所收集的基因測(cè)序的數(shù)據(jù)以及生物分子結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ)，首先通過(guò)X射線-單晶衍射等技術(shù)獲得受體大分子結(jié)合部位的結(jié)構(gòu)，然后通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)搜尋或者全新藥物分子設(shè)計(jì)技術(shù)識(shí)別得到分子形狀和理化性質(zhì)與受體作用相匹配的分子。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)，有些類(lèi)似與AI建模。對(duì)于人工智能系統(tǒng)來(lái)說(shuō)，其所建立的參數(shù)規(guī)模越大，往往就越聰明。藥物的虛擬篩選也是一樣，當(dāng)其數(shù)據(jù)庫(kù)中，所收集的生物分子信息與基因序列越多，其所能產(chǎn)生先導(dǎo)化合物的可能性就越大。因此，效率也就越高。

然而，對(duì)于生命科學(xué)而言，基因測(cè)序與分子動(dòng)力模擬所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)量巨大，要建立如此大的模型算力成本自然十分高昂，很大程度上阻礙了科研人員對(duì)藥物虛擬篩選的深入研究。

針對(duì)這一難題，北鯤云創(chuàng)始人馮建新在公司成立之初就曾表示，北鯤云超算平臺(tái)是專(zhuān)注于為高算力需求的企業(yè)和科研人員提供靈活、高效的算力產(chǎn)品及服務(wù)，幫助客戶提升業(yè)務(wù)運(yùn)行效率并有效降低成本。北鯤云超算平臺(tái)，通過(guò)接入主流公有云資源，并在全球擁有25個(gè)地域節(jié)點(diǎn)，超過(guò)10萬(wàn)臺(tái)服務(wù)器，單集群節(jié)點(diǎn)可提供10，000核時(shí)算力，算力資源豐富，可隨時(shí)開(kāi)啟高性能計(jì)算，作業(yè)排隊(duì)時(shí)間趨近于0.

北鯤云作為一家技術(shù)型公司，不斷提高云資源的優(yōu)化和管理，讓用戶真正體驗(yàn)到云計(jì)算帶來(lái)的優(yōu)勢(shì)。

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