資料介紹
基因組測序技術(shù)的快速發(fā)展使得生物數(shù)據(jù)庫中的基因和基因組序列數(shù)據(jù)數(shù)量迅速增加,但其中仍有大量基因功能是未知的。為此,提出基于異質(zhì)網(wǎng)絡(luò)層次注意力機(jī)制的基因節(jié)點表示學(xué)習(xí)方法HAGE,用以預(yù)測基因功能。結(jié)合多種來源的數(shù)據(jù)集,構(gòu)建一個具有節(jié)點屬性的基因功能相關(guān)異質(zhì)網(wǎng)絡(luò),在網(wǎng)絡(luò)中使用層次注意力機(jī)制為每一個基因節(jié)點學(xué)習(xí)一個節(jié)點嵌入向量,該向量可用于后續(xù)的基因功能預(yù)測等任務(wù)。實驗結(jié)果表明,與Graphsage和GAT等方法相比,HAGE具有更好的預(yù)測性能。
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