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針對(duì)DNA 片段拼接中的重復(fù)序列識(shí)別及屏蔽問(wèn)題，提出一種預(yù)歸并重復(fù)序列屏蔽方法。在片段拼接前通過(guò)掃描子串標(biāo)識(shí)出可能存在重疊關(guān)系的shotgun 片段，利用子串歸并該相關(guān)片段，標(biāo)識(shí)出重復(fù)序列的位置信息，達(dá)到屏蔽的目的。計(jì)算機(jī)模擬分析表明，該方法識(shí)別重復(fù)序列的錯(cuò)誤率低，通過(guò)預(yù)歸并有效縮減了shotgun 集合的規(guī)模，降低了拼接時(shí)的計(jì)算復(fù)雜度。
關(guān)鍵詞：片段拼接；預(yù)歸并；重復(fù)序列；屏蔽
關(guān)鍵詞：片段拼接；預(yù)歸并；重復(fù)序列；屏蔽
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