百度釋出新AI算法 可提升腫瘤辨識效率與正確性

百度硅谷AI Lab發(fā)表新的深度學(xué)習(xí)算法NCRF(Neural Conditional Random Field)，據(jù)稱可改善目前活體組織切片檢查WSI(Whole Slide Image)分析的結(jié)果，協(xié)助病理學(xué)家提升腫瘤辨識效率與正確性。百度并以開源方式，在GitHub釋出該算法。

據(jù)報導(dǎo)，WSI是數(shù)GB大的影像檔，通常包含數(shù)十億畫素(pixel)，病理學(xué)家必須仔細(xì)檢視病理切片影像尋找腫瘤細(xì)胞，但微轉(zhuǎn)移(micrometastases)的小群腫瘤細(xì)胞直徑可小到1,000畫素，因此要從巨大的病理切片影像中有效分析辨識猶如大海撈針。即使運(yùn)用深度學(xué)習(xí)算法，也僅能檢驗WSI影像的一部分。

目前許多WSI的深度學(xué)習(xí)算法，選擇將影像分割為如256x256畫素較小的尺寸獨立進(jìn)行分析，但腫瘤周圍特別是腫瘤與正常細(xì)胞交界處的影像會影響預(yù)測結(jié)果，由于這些算法的深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)無法將周圍的影像一并納入分析，反而增加從分割影像預(yù)測腫瘤的難度，經(jīng)常導(dǎo)致偽陽性誤判。

百度的NCRF算法運(yùn)用CRF建立分割后相鄰影像之間空間相關(guān)性(spatial correlation)模型，不需經(jīng)過前置或后續(xù)處理，即可以標(biāo)準(zhǔn)back-propagation算法進(jìn)行端對端訓(xùn)練。CNN會從影像擷取特征，然后運(yùn)用機(jī)率圖形模式(probabilistic graphical model)聚合相鄰影像的信息納入分析，因此能改善腫瘤預(yù)測、減少偽陽性誤判。

以Camelyon16資料集(dataset)測試百度的NCRF算法，腫瘤定位準(zhǔn)確度(FROC)平均分?jǐn)?shù)可達(dá)0.8096，優(yōu)于專業(yè)病理學(xué)家的0.7240與Camelyon16挑戰(zhàn)賽的前記錄0.8074。不過百度研究人員認(rèn)為，NCRF最合適的應(yīng)用方式還是做為人類專家的輔助工具，讓病理學(xué)家有更多時間專注于算法標(biāo)記出的腫瘤區(qū)域。

NCRF算法為通用技術(shù)，但受限于訓(xùn)練用資料集的數(shù)量與規(guī)模，目前主要使用乳癌的公共資料，百度希望大陸醫(yī)院能提供更多更大型的資料集，進(jìn)行近一步的臨床研究，以徹底評估算法，并驗證在其它類型腫瘤的應(yīng)用。然而要將NCRF算法集成至現(xiàn)有病理切片分析儀器需要配套法規(guī)，但目前尚缺具體指導(dǎo)原則，實際應(yīng)用于臨床病例還要一段時間。