想象一下,如果我們身體里的細(xì)胞無法全部打亂成均勻分布會(huì)怎樣?實(shí)際上,在那種情況下,基本已經(jīng)只能算是一個(gè)巨型的多細(xì)胞團(tuán)了,因?yàn)樵谏矬w內(nèi),只有各種不同的細(xì)胞能夠被精確的分選定位,才能形成一個(gè)具有多功能分區(qū)且能夠執(zhí)行正常生理活動(dòng)的生物有機(jī)體。
類似的問題如果放到人工研究體系,也是殊途同歸,比如近年來發(fā)展的液滴微流控是一種強(qiáng)大的技術(shù)平臺(tái),可用于多種生物學(xué)應(yīng)用,包括單細(xì)胞遺傳學(xué)、抗體發(fā)現(xiàn)和定向進(jìn)化,但要想篩選在化學(xué)組成上不同的液滴目前仍面臨困難??墒聦?shí)上,在化學(xué)成分不同的液滴中進(jìn)行以細(xì)胞為基礎(chǔ)的生物化學(xué)分析具有許多獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),尤其是在減少樣品量、成本以及提高產(chǎn)量等方面。此外,根據(jù)所需特征對(duì)不同組分液滴進(jìn)行分類的能力十分關(guān)鍵,特別是在分離生物或化學(xué)篩選的命中,如可溶性細(xì)胞產(chǎn)物如抗體的篩選以及藥物的篩選等。因此,按需分選生產(chǎn)具有不同化學(xué)組成的液滴對(duì)基礎(chǔ)和臨床研究都具有重大意義。
新方法&新平臺(tái)
近日,來自歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的Christoph A. Merten教授團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一種升級(jí)版的微流控技術(shù)平臺(tái)(micro?uidic Braille valve platform,簡(jiǎn)稱Braille Display,BD),用于按需生成具有不同化學(xué)成分(16種不同試劑及其組合)的液滴,并且能根據(jù)熒光信號(hào)對(duì)具有不同化學(xué)性質(zhì)的液滴進(jìn)行分選。該技術(shù)平臺(tái)結(jié)構(gòu)緊湊、功能多樣,并且成本效益較高。在應(yīng)用測(cè)試方面,這一新型微流控技術(shù)平臺(tái)成功完成了針對(duì)74種情況篩選癌細(xì)胞藥物敏感性的全過程,且能夠根據(jù)酶活性對(duì)不同的液滴進(jìn)行分類。
圖1?微流控技術(shù)集成平臺(tái)用于藥物篩選和液滴分選
平臺(tái)搭建
研究人員首先對(duì)芯片構(gòu)造進(jìn)行了設(shè)計(jì)。具體來看,在微流控芯片的常規(guī)基礎(chǔ)上,BD平臺(tái)采用64個(gè)針口以4×16的矩陣進(jìn)行排列,并安裝控制器用于驅(qū)動(dòng),以打開和關(guān)閉上述芯片上的微閥,從而可以控制和混合16種注入溶液或在微通道中分選液滴(每個(gè)分選通道僅使用4個(gè)針口)。
圖2?總體芯片以及組合控制生產(chǎn)示意圖
系統(tǒng)配備
將芯片平臺(tái)建造好后,則需要定制設(shè)定靈活的軟件控制系統(tǒng),來實(shí)現(xiàn)多樣的功能,充分發(fā)揮BD的強(qiáng)大性能。為了充分適配和發(fā)揮平臺(tái)的多樣功能,研究人員共設(shè)計(jì)了12種應(yīng)用程序用于實(shí)現(xiàn)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,例如?yīng)用程序A:藥物篩選型,其中還包括數(shù)據(jù)分析的詳細(xì)信息;以及應(yīng)用程序B:液滴分選型,包括分選芯片的制備、實(shí)驗(yàn)設(shè)置和數(shù)據(jù)評(píng)估。
圖3?分析方法的工作流程示意圖
應(yīng)用示例
(1)組合藥物篩選 在進(jìn)行組合藥物篩選時(shí),主要分為三個(gè)步驟:(i)藥物和對(duì)照品的制備;(ii)編碼;(iii)BD上的芯片對(duì)接。對(duì)于該研究設(shè)計(jì)的平臺(tái),體系優(yōu)化后選擇在每個(gè)樣本約100個(gè)細(xì)胞的群體水平上進(jìn)行分析,從而可以保障更多的細(xì)胞-細(xì)胞相互作用,提高藥物反應(yīng)。然而,從細(xì)胞群體水平來看,只有最有效的藥物或藥物組合才能被識(shí)別,而單個(gè)耐藥克隆可能無法分析到。因此,BD平臺(tái)也被用于生成具有不同化學(xué)成分的單細(xì)胞液滴(每個(gè)受試藥物約250個(gè)重復(fù)組),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)單個(gè)耐藥克隆的識(shí)別。然而,需要注意的是,單細(xì)胞液滴形式阻止了幾乎所有類型的細(xì)胞-細(xì)胞相互作用,因而可能導(dǎo)致藥物敏感性的改變,可以根據(jù)自己的具體應(yīng)用和科學(xué)問題選擇分析模式,或者是進(jìn)行兩種模式的混合篩選。
圖4?組合藥物篩選的實(shí)驗(yàn)裝置及過程
(2)液滴篩選
BD技術(shù)的另一個(gè)應(yīng)用是其用于化學(xué)上不同的液滴進(jìn)行分類篩選。該研究首先采用了基于熒光的條形編碼策略,只要樣品保持在連續(xù)微流陣列中,這些熒光編碼策略就可用于明確標(biāo)記所有的液滴。此外,研究進(jìn)一步通過在封裝前用抗體對(duì)細(xì)胞進(jìn)行染色來確定每個(gè)栓塞的相對(duì)細(xì)胞數(shù),以提高微流體篩網(wǎng)的可靠性。所使用的抗體可以與生物酶偶聯(lián),該酶可以將安培紅(Amplex Red)轉(zhuǎn)化為試鹵靈(resorufin),產(chǎn)生紅色熒光達(dá)到對(duì)液滴的標(biāo)記。
研究通過試驗(yàn)成功實(shí)現(xiàn)了基于圖像分析的液滴、細(xì)胞和果蠅胚胎分選。此外,該平臺(tái)可以進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)多達(dá)八種方式的分選模式,與常規(guī)的二元熒光強(qiáng)度不同,八向排序可以實(shí)現(xiàn)更細(xì)微的差異研究,如通過將液滴收集到不同強(qiáng)度的“箱”中并進(jìn)行下游分析,可以研究目標(biāo)群體中的熒光強(qiáng)度梯度。因此,BD分選集成的平臺(tái)不僅可以分析不同藥物處理對(duì)樣本的影響,還可以物理分離感興趣的特定樣本群進(jìn)行下游分析(例如,成像和測(cè)序)。
圖5?根據(jù)酶活性對(duì)液滴進(jìn)行分類
平臺(tái)優(yōu)勢(shì)及應(yīng)用總結(jié)
綜合效率和應(yīng)用潛力進(jìn)行分析,與現(xiàn)有的技術(shù)相比,該集成型BD微流控平臺(tái)的主要優(yōu)勢(shì)則是成本低、靈活性高,可實(shí)現(xiàn)諸如聯(lián)合藥物篩選和個(gè)性化癌癥治療等不同的應(yīng)用,也可以用于進(jìn)行細(xì)胞、胚胎或液滴的多通道分選制備。該技術(shù)的進(jìn)一步優(yōu)化包括提升微流速度已經(jīng)降低整體成本,從而應(yīng)用去其他更多的領(lǐng)域,如組合篩選用于觸發(fā)細(xì)胞命運(yùn)的最佳生長(zhǎng)因子組合,可用于細(xì)胞分化、再生醫(yī)或出生缺陷的預(yù)防和治療等。此外,因?yàn)樵撈脚_(tái)根據(jù)自動(dòng)圖像分析分離樣品進(jìn)行特異性分析,有望在基于光學(xué)顯微鏡成像的發(fā)育生物學(xué)中獲得相關(guān)應(yīng)用。
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