NVIDIA BioNeMo 現(xiàn)已提供十余個生成式 AI 模型以及云服務(wù),正在推動計算機(jī)輔助藥物發(fā)現(xiàn)生態(tài)系統(tǒng)的發(fā)展。
數(shù)字生物學(xué)和生成式 AI 正在幫助重塑藥物發(fā)現(xiàn)、外科手術(shù)、醫(yī)學(xué)影像和可穿戴設(shè)備,這或?qū)⒊蔀樽杂嬎銠C(jī)出現(xiàn)以來醫(yī)療行業(yè)最引人注目的變革。
十多年來,NVIDIA 一直在為這一變革做準(zhǔn)備,積累深厚的專業(yè)知識,打造 NVIDIA Clara 醫(yī)療計算平臺,并擴(kuò)大與龐大的合作伙伴生態(tài)系統(tǒng)的合作。醫(yī)療領(lǐng)域的客戶和合作伙伴每年在 NVIDIA GPU 計算上的投入已遠(yuǎn)超 10 億美元(包含直接或通過云計算合作伙伴間接的支出)。
在 2500 億美元的藥物研發(fā)領(lǐng)域,這些努力迎來了一個拐點:研發(fā)團(tuán)隊現(xiàn)在可以使用計算機(jī)來加速藥物研發(fā)。
借助新興的生成式 AI 工具,藥物研發(fā)團(tuán)隊可以觀察到特定的氨基酸或核苷序列、結(jié)構(gòu)、功能和意義的基本組成部分,從而生成或設(shè)計出可能具有所需特性的新型分子。這將使研究人員能夠篩選出更精確的候選藥物來推進(jìn)研究,減少昂貴、耗時的物理實驗工作。
NVIDIA BioNeMo 正在加速這一變革,它是一個生成式 AI 平臺,可為藥物研發(fā)提供開發(fā)、定制和部署基礎(chǔ)模型所需的服務(wù)。
BioNeMo 已在制藥公司、科技生物公司和軟件公司中被廣泛采用。它提供了一種全新的計算方法,使科學(xué)家能夠在低代碼、用戶友好的環(huán)境進(jìn)行生成式 AI 研究,從而減少實驗,甚至在某些情況下可以完全取代實驗。
除了通過 BioNeMo 開發(fā)、優(yōu)化和托管 AI 模型之外,NVIDIA 還通過對創(chuàng)新型科技生物公司的投資來推動計算機(jī)輔助藥物發(fā)現(xiàn)生態(tài)系統(tǒng)的發(fā)展,例如生物制藥公司 Recursion(向 BioNeMo 用戶提供該公司的一款基礎(chǔ)模型),以及生物技術(shù)公司 Terray Therapeutics(該公司正在使用 BioNeMo 開發(fā) AI 模型)。
BioNeMo 讓 AI 加速的
藥物發(fā)現(xiàn)更加精準(zhǔn)
BioNeMo 具有一套預(yù)訓(xùn)練的生物分子 AI 模型,可用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、蛋白質(zhì)序列生成、分子優(yōu)化、生成式化學(xué)、對接預(yù)測等。它還使計算機(jī)輔助藥物發(fā)現(xiàn)公司能夠通過易于訪問的應(yīng)用程序編程接口(API)向廣大用戶提供模型,用于推理和定制化模型開發(fā)。
借助 BioNeMo ,藥物研發(fā)團(tuán)隊可以使用其專有數(shù)據(jù)來構(gòu)建或定制生成式 AI 模型。藥物研發(fā)軟件公司、生物技術(shù)公司和大型制藥公司正在將 BioNeMo 云 API(預(yù)計本月發(fā)布測試版)集成到提供計算機(jī)輔助藥物發(fā)現(xiàn)工作流的平臺中。
云 API 將包含許多基礎(chǔ)模型,其來源有三個途徑:
NVIDIA 創(chuàng)建的模型,如用于生成小分子的 MolMIM 生成式化學(xué)模型;
全球研究團(tuán)隊首創(chuàng),并由 NVIDIA 進(jìn)行篩選和優(yōu)化的開源模型,如 OpenFold 蛋白質(zhì)預(yù)測 AI;
NVIDIA 合作伙伴開發(fā)的私有模型,如 Recursion 公司用于嵌入細(xì)胞顯微鏡圖像的 Phenom-Beta。
MolMIM 在生成小分子的同時,還能讓用戶對 AI 生成過程進(jìn)行更精細(xì)的控制——即識別具有所需特性并符合用戶指定約束的新分子。例如,研究人員可以指導(dǎo)模型生成與特定參考分子具有相似結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的分子。
制藥業(yè)的現(xiàn)象級 AI:Recursion為
BioNeMo帶來 Phenom-Beta 模型
Recursion 是首家通過 BioNeMo 云 API 提供 AI 模型的托管合作伙伴:Phenom-Beta 是一種視覺轉(zhuǎn)換器模型 ,可以從細(xì)胞顯微鏡圖像中提取具有生物學(xué)意義的特征。
該功能可為研究人員提供關(guān)于細(xì)胞功能的洞察,并幫助他們了解細(xì)胞如何對候選藥物或基因工程做出反應(yīng)。
圖注:Phenom-Bete 在圖像重建任務(wù)中表現(xiàn)出色,該任務(wù)是評估模型性能的訓(xùn)練指標(biāo)
眾多企業(yè)正在采用 NVIDIA BioNeMo
越來越多的科學(xué)家、生物技術(shù)和制藥公司以及 AI 軟件供應(yīng)商采用 NVIDIA BioNeMo 來支持生物學(xué)、化學(xué)和基因組學(xué)研究。
審核編輯:劉清
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原文標(biāo)題:NVIDIA 生成式 AI 開啟藥物研發(fā)與設(shè)計的新紀(jì)元
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