DolphinDB 是一家高性能數(shù)據(jù)庫研發(fā)企業(yè),也是 NVIDIA 初創(chuàng)加速計劃成員,其開發(fā)的產(chǎn)品基于高性能分布式時序數(shù)據(jù)庫,是支持復(fù)雜計算和流數(shù)據(jù)分析的實時計算平臺,適用于金融、電力、物聯(lián)網(wǎng)和零售等行業(yè)。
DolphinDB 公司推出的 CPU-GPU 異構(gòu)計算平臺 Shark,將 DolphinDB 上的復(fù)雜指標(biāo)計算能力無縫切換到 GPU 算力平臺,從而大幅提升了計算性能。
DolphinDB 開發(fā)團隊與 NVIDIA 團隊合作,通過利用NVIDIA RAPIDS加速 Shark 異構(gòu)計算平臺的因子挖掘算法運行效率,幫助 Shark 將因子挖掘的效率提升 2 - 10 倍,并基于NVIDIA cuDF實現(xiàn) Shark 因子高效計算,大幅減少開發(fā)成本,縮短開發(fā)周期。
RAPIDS 的 RMM 是一套開源的內(nèi)存/顯存管理庫,提供 C++ 和 Python 接口,相比 cuMalloc、cuFree 等操作來講,具有更好的性能和靈活性;RAPIDS libcudf 是基于 GPU 的 C++ DataFrame 庫,提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),并且內(nèi)置了基礎(chǔ)的函數(shù)算子。
Shark 的因子挖掘功能,能通過利用遺傳算法從數(shù)據(jù)中挖掘出有效的因子。在這一場景中,遺傳算法會隨機生成大量因子并進行計算。這一過程會頻繁地創(chuàng)建和釋放臨時空間來存儲中間結(jié)果,直接使用原生的 CUDA C 顯存分配和釋放接口,會嚴重降低執(zhí)行效率。
Shark 的因子計算功能,針對金融領(lǐng)域的數(shù)據(jù)分析與處理,提供了豐富的函數(shù)庫。如果從零開始將 CPU 的函數(shù)遷移至 GPU,需要為 GPU 重新實現(xiàn)一套底層數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)以及基礎(chǔ)計算函數(shù),會導(dǎo)致開發(fā)周期的延長以及開發(fā)成本的增加。
基于以上挑戰(zhàn),DolphinDB 開發(fā)團隊與 NVIDIA 團隊及 RAPIDS 開發(fā)團隊合作,通過利用 RAPIDS RMM,解決因子挖掘過程中頻繁申請和釋放顯存導(dǎo)致的性能問題;通過基于 RAPIDS libcudf 進行二次開發(fā),實現(xiàn)因子計算,從而縮短開發(fā)周期,降低開發(fā)成本。
Shark 進行因子挖掘時,會通過遺傳算法隨機生成海量的因子計算公式。這些公式長度不等,接受的參數(shù)數(shù)量也不盡相同。因此在計算時,需要頻繁地申請和釋放臨時空間用于存儲中間結(jié)果。DolphinDB 開發(fā)團隊通過使用 RMM 對顯存進行池化,從而對中間結(jié)果所使用的顯存進行高效地分配、釋放和重用。
Shark 支持用戶輸入自定義的公式,自動將自定義公式轉(zhuǎn)換為計算圖,并在 GPU 完成計算,從而加快數(shù)據(jù)分析和處理的效率。如果從零開始將 DolphinDB 的計算函數(shù)遷移至 Shark,則需要在 GPU 構(gòu)建 array、table 等底層數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),并實現(xiàn)大量基礎(chǔ)計算函數(shù)。經(jīng)過調(diào)研后,DolphinDB 開發(fā)團隊決定基于 RAPIDS libcudf 進行二次開發(fā),復(fù)用 cuDF 的 column、table 等底層數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),并借助 cuDF 的 groupby 和 rolling 框架,只需要完成算子的核心計算邏輯,即可完成 DolphinDB 時序算子和橫截面算子的遷移,這樣不僅極大提升了開發(fā)效率,還降低了開發(fā)成本。
下圖展示了在不同規(guī)模數(shù)據(jù)下,使用 RAPIDS 的 RMM 顯存管理庫相對于原生的 CUDA 顯存分配 API,Shark 因子挖掘效率的對比??梢郧宄乜吹剑褂?RMM 可以顯著提升 Shark 因子挖掘效率,最高可達到 10 倍的加速比。
除此之外,Shark 通過使用 RAPIDS libcudf,大大提升了因子的計算效率。下圖中對比了 1000 個 group,每個 group 有 10 萬行的數(shù)據(jù),采用分組方式計算下面的算子。可以看到與 CPU 相比,利用 GPU 總體耗時(包含拷貝時間),基本達到了一個數(shù)量級的加速比。
借助 RAPIDS ,Shark 的因子挖掘效率提升了 10 倍。除此之外,基于 cuDF 進行二次開發(fā),只需要實現(xiàn)算子的核心邏輯,就可以達到一個數(shù)量級的加速,并極大降低了算子遷移成本。
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原文標(biāo)題:NVIDIA RAPIDS 助力 Shark 平臺實現(xiàn)高效數(shù)據(jù)挖掘和計算
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