基于衰減系數(shù)的動(dòng)態(tài)蛋白質(zhì)預(yù)測網(wǎng)絡(luò)模型
資料介紹
在生物系統(tǒng)的轉(zhuǎn)變過程中,蛋白質(zhì)的演化過程并非一成不變,而是動(dòng)態(tài)變化的。通過構(gòu)造模型的方法來研究蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),可以較好地刻畫蛋白質(zhì)相互作用的演化機(jī)制。但是,利用構(gòu)造模型的方法來研究動(dòng)態(tài)蛋白質(zhì)相互作用時(shí),應(yīng)該考慮在蛋白質(zhì)演化過程中,歷史蛋白質(zhì)隨著時(shí)間推移對整個(gè)演化過程產(chǎn)生作用可能產(chǎn)生的衰減,而不是將不同時(shí)刻的蛋白質(zhì)的作用視為等同或者直接忽略。針對上述情況,提出一種基于衰減系數(shù)建立動(dòng)態(tài)蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)模型的方法。該方法在建立模型的時(shí)候采用合理的衰減系數(shù)將蛋白質(zhì)作用的變化情況記錄下來,以便于之后研究的開展。通過實(shí)驗(yàn),取合理的衰減系數(shù)后,使用相同算法在不同網(wǎng)絡(luò)模型上運(yùn)行,結(jié)果驗(yàn)證了所提算法的有效性。
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